Venerdì ore 14-16 in ufficio 112, Dipartimento di Statistica, Informatica e Applicazioni "Giuseppe Parenti", viale Morgagni 59. E' fortemente raccomandato prendere un appuntamento per email o prenotandosi a questo link.
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Nel Marzo 2016 Chiara Marzi ha conseguito la Laurea Magistrale in Ingegneria Biomedica presso l’Alma Mater Studiorum – Università di Bologna, con votazione 110/110 e lode, per la discussione di una tesi sperimentale dal titolo “Geometria frattale: analisi della lacunarità cerebrale in MRI”.
Nel Novembre 2016 la dott.ssa Marzi ha vinto il concorso per l’ammissione al XXXII ciclo del dottorato di ricerca in “Ingegneria Biomedica, Elettrica e dei Sistemi” presso l’Università di Bologna. Durante l’attività di dottorato Chiara Marzi ha approfondito aspetti teorici e di implementazione computazionale ad alta efficienza di metodi di elaborazione di immagini 3D basati sulla geometria frattale. Una prima release del software per il calcolo della dimensione frattale delle bioimmagini è gratuitamente disponibile per facilitare le applicazioni della FD negli studi clinici (https://github.com/chiaramarzi/fractalbrain-toolkit). Durante il periodo di dottorato la dott.ssa Marzi ha trascorso un periodo a Boston, dove ha lavorato con il gruppo del Massachusetts General Hospital Stroke Research Center, Dipartimento di Neurologia della Harvard Medical School. Il progetto, finanziato dal programma Marco Polo dell’Università di Bologna ed approvato dal Massachusetts General Hospital, era intitolato "Fractal dimension as a measure of cortical complexity of patients with cerebral amyloid angiopathy (CAA)". Nel 2020 ha conseguito il titolo di Dottore di Ricerca discutendo la tesi “Fractal descriptors for quantifying brain complexity in MRI”. La commissione giudicatrice, all’unanimità, ha giudicato eccellenti il lavoro svolto e l’elaborato prodotto. Per il lavoro di tesi Chiara Marzi ha vinto il premio di Dottorato “Alberto Mazzoldi” 2020 istituito dal Gruppo Nazionale di Bioingegneria (GNB) e finanziato dall’Università di Pisa.
Nello stesso anno la dott.ssa Marzi ha ottenuto il conferimento di un assegno di ricerca presso il Dipartimento di Scienze Mediche e Chirurgiche Avanzate del Dipartimento di Scienze Mediche e Chirurgiche Avanzate, relativo al programma "Correlati strutturali e funzionali in RM della dissociazione cognitiva-radiologica in pazienti affetti da Sclerosi Multipla". Contemporaneamente, ella ha partecipato al progetto "The Italian Neuroimaging Network Initiative (INNI)", finanziato dalla Fondazione Italiana Sclerosi Multipla (FISM).
La dott.ssa Marzi, nel 2021 ha ottenuto un assegno di ricerca sul tema “Analisi di dati clinici (immagini di risonanza magnetica e TC in particolare) con tecniche di machine e deep learning. Estrazione di biomarkers dalle immagini e loro validazione statistica nell’ambito dei progetti Navigator, ProCancer-I e Optimised” presso l’Istituto di Fisica Applicata "Nello Carrara" (IFAC) del Consiglio Nazionale delle Ricerche (CNR). In particolare, ella ha partecipato attivamente alla definizione ed implementazione di biomarcatori radiologici, utili nella descrizione di tre particolari tipi di tumore (prostata, colon-retto e stomaco) con lo scopo di standardizzare ed approfondire le metodologie capaci di descrivere accuratamente le tre tipologie di tumore sopra elencate.
Recentemente, la dott.ssa Marzi ha co-organizzato la scuola nazionale di "Biofotonica e Intelligenza Artificiale" (5 - 9 settembre 2022, Firenze, Italia), coordinando anche il datathon, un’esperienza di gruppo incentrata sull’analisi dei dati biofotonici con tecniche di apprendimento automatico.
Dal 2016 al 2019 la dott.ssa Marzi ha svolto attività didattica integrativa per l’insegnamento "Elaborazione di dati e segnali biomedici" (SSD ING-INF/06 - corso di Laurea Magistrale in Ingegneria Biomedica presso l’Università di Bologna). Dal 2020 al 2022 ella è stata tutor didattico del corso "Laboratorio di ingegneria informatica biomedica" (SSD ING-INF/05 - corso di Laurea in Ingegneria Biomedica presso l’Università di Bologna). Dal 2021 la dott.ssa Marzi è professoressa a contratto dei corsi "Biological System Modeling" e "Biomedical Signal Processing and Machine Learning" (corso di Laurea Magistrale in Biomedical Engineering presso l’Università di Bologna).
Dal 2016 ad oggi, Chiara Marzi è membro del Gruppo Nazionale di Bioingegneria (GNB) (di cui è anche è socio fondatore) e della IEEE (Institute of Electrical and Electronics Engineers), con affiliazione in IEEE Engineering in Medicine and Biology Society.
Nel 2022 Chiara Marzi è stata eletta membro della Sigma Xi, The Scientific Research Honor Society.
ISTRUZIONE e FORMAZIONE
2020 - Ph.D. in Ingegneria Biomedica, Elettrica, e dei Sistemi, Alma mater Studiorum - University of Bologna, Italy
2016 - Laurea magistrale in Ingegneria Biomedica, Alma mater Studiorum - University of Bologna, Italy
2013 - Laurea triennale in Ingegneria Biomedica, Alma mater Studiorum - University of Bologna, Italy
POSIZIONI ACCADEMICHE
2022 -oggi: Ricercatrice a tempo determinato (legge 30 dicembre 2010, n. 240, art. 24, comma 3, lettera a), Università di Firenze, Dipartimento di Statistica, Informatica e Applicazioni - DiSIA, SSD: MED/01.
2021 - 2022: Assegnista di Ricerca Post-Doc, Consiglio Nazionale delle Ricerche - CNR, Istituto di Fisica Applicata "Nello Carrara" - IFAC, Sesto Fiorentino, Firenze.
2020 - 2021: Assegnista di Ricerca Post-Doc, Dipartimento di Scienze Mediche e Chirurgiche Avanzate, Università degli Studi della Campania "Luigi Vanvitelli", Napoli.
PREMI
- Premio di Dottorato "Alberto Mazzoldi" - Università di Pisa, conferito dal Gruppo Nazionale di Bioingegneria 2020
- Vincitrice Programma Marco Polo, Seconda tornata 2016, Università di Bologna
PRINCIPALI PROGETTI NAZIONALI ED INTERNAZIONALI
- "Fractal Dimension Maps of brain MRI and decentralized deep learning for prediction in Friedreich ataxia and SCAs using the ENIGMA-Ataxia meta-dataset (FDM-AI)" - Telethon Seed Grant 2022
- "OPTIMISED": Creazione di un percorso ottimizzato per il flusso dei dati e la gestione del paziente con quadro clinico e radiologico compatibile con COVID-19" (bando RICERCA COVID-19 TOSCANA) 2020
- "An Imaging Biobank to Precisely Prevent and Predict cancer, and facilitate the Participation of oncologic patients to Diagnosis and Treatment (NAVIGATOR)" (bando RICERCA SALUTE 2018)
- "Intelligenza artificiale per la predizione individuale: la dimensione frattale dell’encefalo nella atassia di Friedreich e nelle atassie spinocerebellari (SCA) nel network internazionale ENIGMA-Ataxia (FLEX-AI)" - elethon Seed Grant 2020
ATTIVITA' DIDATTICA
A.A. 2022-2023
Statistica Medica - Corso di Laurea Magistrale a Ciclo Unico in Odontoiatria e Protesi Dentaria - Università di Firenze, Italy
Biomedical Signal Processing and Machine Learning (Module 2) - Master's Degree in Biomedical Engineering - Alma Mater Studiorum Università di Bologna.
A.A. 2021-2022
Biological System Modeling (Module 2) - Master's Degree in Biomedical Engineering - Alma Mater Studiorum Università di Bologna.
Tutor didattico del Laboratorio di ingegneria informatica biomedica - Alma Mater Studiorum Università di Bologna.
A.A. 2020-2021
A.A. 2018-2019
Attività didattica integrativa per l’insegnamento "Elaborazione di dati e segnali biomedici", corso di Laurea Magistrale in Ingegneria Biomedica dell’Università di Bologna, Campus di Cesena.
A.A. 2017-2018
A.A. 2016-2017
PRESENTAZIONI E SEMINARI SU INVITO
- "Artificial intelligence and radiomics: good and bad habits", Memorial Dr. Fausto Chionne, DALL’INTELLIGENZA ARTIFICIALE ALLA MEDICINA PREDITTIVA E DI PRECISIONE QUALI SVILUPPI IN SANITÀ, Città della Pieve (Perugia) - Chiesa Sant’Agostino, 13 ottobre 2022
- "Buone pratiche per il machine learning", Scuola nazionale di Biofotonica ed Intelligenza Artificiale, Firenze, 5 settembre 2022
- "Validazione efficace dei modelli di machine learning", Scuola nazionale di Biofotonica ed Intelligenza Artificiale, Firenze, 7 settembre 2022
- "The fractal geometry of the brain", Scuola IMT Alti Studi Lucca, 8 luglio 2022
- "Artificial Intelligence in Neuroimaging: future challenges", Master di II livello in Data Science e Statistical Learning, 5 luglio 2022
- "Artificial Intelligence in Neuroimaging", 5th Seminar -D2 Seminar Series - Florence Center for Data Science, 15 ottobre 2021
- “From brain complexity in MRI to Artificial Intelligence for Health”, presso Istituto di Fisica Applicata "Nello Carrara" (IFAC) - Consiglio Nazionale delle Ricerche (CNR), 21 aprile 2021
- “A quick look at the fractal geometry of the brain”, presso MGH, Stroke Research Center, 175 Cambridge Street, MA, USA, 18 dicembre 2017
- “La geometria frattale del cervello”, presso Dipartimento di Matematica – Alma Mater Studiorum, Università di Bologna, 26 giugno 2017
- “Geometria frattale e neuroimmagini”, presso l’Unità di Radiodiagnostica dell’Ospedale “Versilia”, AUSL 12 Viareggio, Lido di Camaiore (Lu), 18 febbraio 2016
GRUPPI DI LAVORO INTERNAZIONALI
- ENIGMA-Ataxia meta-analysis working group (2016 to present)
SOCIETà SCIENTIFICHE
- Associazione Italiana di Epidemiologia (AIE) - 2023
- Società Italiana di Statistica Medica ed Epidemiologia Clinica (SISMEC) - 2023
- IEEE e IEEE Engineering in Medicine and Biology Society, member: 2021 - oggi, student member: 2016-2020
- Gruppo Nazionale di Bioingegneria (GNB): 2016 - oggi
INTERESSI DI RICERCA
Tecniche di Machine Learning per l'analsi di dati di salute e medicina, armonizzazione di dati medici per le mega-analisi, stabilità della feature selection, analisi frattale delle neuro immagini e dei segnali fisiologici.
Legenda
In March 2016, Chiara Marzi received her Master's degree in Biomedical Engineering from Alma Mater Studiorum - University of Bologna, with a grade of 110/110 cum laude, for the discussion of an experimental thesis entitled "Fractal Geometry: analysis of cerebral lacunarity in MRI."
From November 2016 to March 2020, Dr. Marzi was enrolled in the "Biomedical, Electrical and Systems Engineering" Ph.D. program at the University of Bologna. During her doctoral activity, Chiara Marzi investigated theoretical aspects and high-efficiency computational implementation of 3D image processing methods based on fractal geometry. In particular, an implementation for fractal dimension (FD) computation was proposed that determined the spatial scales at which the brain is fractal, subject by subject, before estimating FD based on those scales. This improvement made the fractal dimension a measure capable of describing slight structural alterations (not visible to the human eye and not measurable by conventional metrics) of the human brain during physiological development and aging or under pathological conditions. The first release of the fractalbrain toolkit is freely available at https://github.com/chiaramarzi/fractalbrain-toolkit. For her Ph.D. thesis work, Chiara Marzi won the "Alberto Mazzoldi" 2020 Doctoral Prize established by the National Group for Bioengineering (GNB) and funded by the University of Pisa.
Dr. Marzi spent her first post-doc years as a postdoctoral research fellow at the department of Advanced Medical and Surgical Sciences, Vancitelli University, followd by a postdoctoral research fellowship at the Institute of Applied Physics "Nello Carrara" (IFAC) of the National Research Council (CNR). She participated in the projects INNI, Navigator, ProCancer-I, and Optimised to extract and analyze clinical imaging data with machine and deep learning techniques.
EDUCATION
2013 - Bachelor's Degree in Biomedical Engineering, Alma mater Studiorum - University of Bologna, Italy
2016 - Master's Degree in Biomedical Engineering, Alma mater Studiorum - University of Bologna, Italy
2020 - Ph.D. in Biomedical, Electrical, and System Engineering - University of Bologna, Italy
EMPLOYMENT HISTORY
2020 - 2021: Postdoctoral Fellow, Department of Advanced Medical ad Surgical Sciences, University Vanvitelli, Naples, Italy.
2021 - 2022: Postdoctoral Fellow, Institure of Applied Physics, Research National Council (CNR), Sesto Fiorentino, Florence, Italy.
2022 to present: Junior Assistant Professor in Medical Statistics (Ricercatore in Statistica Medica MED/01), Department of Statistics, Computer Science and Applications, University of Florence, Italy.
AWARDS
- Best Ph.D. thesis award "Alberto Mazzoldi - Gruppo Nazionale di Bioingegneria
- Marco Polo scholarship, Alma Mater Studiorum - University of Bologna
MAIN NATIONAL AND INTERNATIONAL PROJECTS
TEACHING ACTIVITIES
Medical Statistics - Corso di Laurea Magistrale a Ciclo Unico in Odontoiatria e Protesi Dentaria - University of Florence, Italy
Educational tutor for the Laboratory of Biomedical computer engineering - Alma Mater Studiorum Università di Bologna.
Integrative teaching activity for Elaborazione di dati e segnali biomedici - Master's Degree in Biomedical Engineering - Alma Mater Studiorum Università di Bologna.
INVITED TALKS AND PRESENTATIONS
- "Artificial intelligence and radiomics: good and bad habits", Memorial Dr. Fausto Chionne, DALL’INTELLIGENZA ARTIFICIALE ALLA MEDICINA PREDITTIVA E DI PRECISIONE QUALI SVILUPPI IN SANITÀ, Città della Pieve (Perugia), Chiesa Sant’Agostino, 13 ottobre 2022
INTERNATIONAL WORKING GROUPS
SCIENTIFIC SOCIETIES
- IEEE e IEEE Engineering in Medicine and Biology Society, member: 2021 to present, student member: 2016-2020
- Gruppo Nazionale di Bioingegneria (GNB): 2016 to present
RESEARCH INTERESTS
Machine learning approches to analyse health data, health data harmonization for mega-analyses, feature selection stability, fractal analysis of neuro images and physiological signals.